Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms