Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim27Q62158 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms