Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HiraQ61666 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HiraQ61666 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms