Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Foxj1Q61660 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxj1Q61660 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms