Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mre11Q61216 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mre11Q61216 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms