Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms