Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
JrkQ60976 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms