Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp3Q60770 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms