Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms