Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprnQ60673 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprnQ60673 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms