Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms