Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q5XFZ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5XFZ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms