Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms