Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms