Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms