Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms