Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Brsk1Q5RJI5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms