Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms