Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms