Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms