Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc8bQ5DU41 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc8bQ5DU41 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms