Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syce1lQ5D525 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms