Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms