Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms