Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap2Q3V1H1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms