Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ampd1Q3V1D3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ampd1Q3V1D3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms