Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms