Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933416C03RikQ3V063 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms