Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc27Q3V036 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc27Q3V036 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms