Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc160Q3UYG1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc160Q3UYG1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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