Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms