Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms