Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms