Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms