Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgef40Q3UPH7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms