Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms