Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms