Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxosQ3UL53 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms