Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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Usp19Q3UJD6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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Usp19Q3UJD6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Usp19Q3UJD6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Usp19Q3UJD6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms