Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms