Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms