Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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