Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hectd3Q3U487 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hectd3Q3U487 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms