Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LcorlQ3U285 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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