Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms