Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
InipQ3TXT3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms