Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dcaf17Q3TUL7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms