Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21440Q3TTD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms