Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fndc4Q3TR08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc4Q3TR08 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms