Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms